人力资源网回答：员工违反了公司的规章制度，只要是满足下面这些条件，公司是可以扣工资的，而且是不违法的。

1.规章制度的内容是合法的，并且经过公司全体员工讨论，公示、员工签字确认等一系列程序。

2.规章制度的内容应该是具有合理性的，如果明确缺乏合理性的奖惩也会影响其合法性。

3.规章制度的内容不能违反法律规定。

从原则上来说，公司是不能扣除员工的工资的，但是公司可以通过规章制度等合法手段，有正当的理由对员工进行奖惩，这也是人力资源管理的一种有效手段。

根据劳动法的有关规定，公司的规章制度如果违反了法律、法规的规定，损害了员工的权益或者以不正当的理由扣除员工工资的，员工可以申请劳动仲裁，维护自己的合法权益，并要求公司支付相应的经济补偿。